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定量蛋白組學分析

定量蛋白組學分析

基于PRM的靶向蛋白質定量分析
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  與常見的大規模的蛋白質組學研究策略不同,靶向蛋白質組學技術是針對選中的目標蛋白或肽段進行監測和定量,被認為是“質譜領域的WB”。三重四級桿(QQQ)類型儀器上實現的SRM技術是質譜領域定量研究的金標準,Nature Methods雜志將其評為“Method of the Year 2012”。
基于SWATH的定量蛋白質組學分析
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(1)背景介紹  經典的定量蛋白質組學分析流程(如上述的iTRAQ,雙甲基化,SILAC等)所采用的質譜掃描模式為DDA(又稱Shotgun,鳥槍法)。SWATH是一種全新的全景式質譜掃描模式,該模式在掃描過程中將樣品中所有的肽段分成若干個窗口,并對每個窗口中的所有肽段進行碎裂,采集二級質譜圖,數據分析時通過靶向提取的分析方式,即可對不同樣品中蛋白進行相對定量分析。SWATH模式克服了DDA模式中
基于標記的定量蛋白質組學分析
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  蛋白質是基因表達產物,在生物體內直接行使功能,因此研究其在各種刺激條件下的變化,為疾病發生等生理過程提供了重要線索。隨著質譜技術發展,高通量蛋白質定量分析日臻完善,一輪實驗周期往往可獲取數千種蛋白的定量信息。
非標記定量蛋白質組學分析
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  定量蛋白質組學是蛋白質組學最重要的應用之一。定量的策略包括標記定量和非標記定量兩大類。非標記定量對實驗過程的操作和質譜儀的狀態要求較高,但以其操作簡便、試劑價格低廉等優勢,同樣受到很多人的關注。
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蛋白質組學

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